Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
RPS29P62273 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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