Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AP1S1P61966 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms