Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VBP1P61758 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms