Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTBP60709 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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