Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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FAM3BP58499 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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FAM3BP58499 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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