Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP107P57740 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP107P57740 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP107P57740 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP107P57740 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP107P57740 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP107P57740 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms