Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKAA2P54646 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA2P54646 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms