Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms