Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA2P51531 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA2P51531 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms