Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TTPAP49638 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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