Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NESP48681 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NESP48681 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NESP48681 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NESP48681 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NESP48681 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NESP48681 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NESP48681 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NESP48681 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NESP48681 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms