Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DCCP43146 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCCP43146 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCCP43146 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCCP43146 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DCCP43146 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms