Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms