Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms