Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms