Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS2P35354 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS2P35354 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms