Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCVRNP35243 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms