Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms