Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms