Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms