Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PLNP26678 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PLNP26678 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms