Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms