Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO1P25800 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO1P25800 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO1P25800 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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