Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms