Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA1P23193 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms