Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD53P19397 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD53P19397 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms