Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFAPP14136 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFAPP14136 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFAPP14136 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFAPP14136 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFAPP14136 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFAPP14136 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFAPP14136 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFAPP14136 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFAPP14136 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFAPP14136 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFAPP14136 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFAPP14136 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFAPP14136 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFAPP14136 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFAPP14136 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFAPP14136 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GFAPP14136 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFAPP14136 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms