Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms