Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT3P12035 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KRT3P12035 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT3P12035 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms