Protein–RNA interactions for Protein: P10145

CXCL8, Interleukin-8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL8P10145 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL8P10145 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms