Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms