Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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PKHD1P08F94 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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PKHD1P08F94 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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