Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSLP07711 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSLP07711 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSLP07711 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSLP07711 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSLP07711 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSLP07711 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSLP07711 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSLP07711 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms