Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA4P06727 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA4P06727 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA4P06727 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOA4P06727 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA4P06727 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA4P06727 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA4P06727 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA4P06727 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA4P06727 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA4P06727 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA4P06727 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA4P06727 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA4P06727 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA4P06727 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA4P06727 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA4P06727 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms