Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms