Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms