Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TO15178 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TO15178 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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