Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms