Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CEP290O15078 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CEP290O15078 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP290O15078 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP290O15078 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CEP290O15078 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CEP290O15078 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CEP290O15078 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP290O15078 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP290O15078 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CEP290O15078 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CEP290O15078 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP290O15078 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP290O15078 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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CEP290O15078 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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