Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1AO15047 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1AO15047 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms