Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms