Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms