Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms