Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms