Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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