Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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UBE2J1Q9Y385 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2J1Q9Y385 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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