Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SORCS3Q9UPU3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SORCS3Q9UPU3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SORCS3Q9UPU3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORCS3Q9UPU3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORCS3Q9UPU3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORCS3Q9UPU3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORCS3Q9UPU3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms