Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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