Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms