Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms